Σύμφωνα με το ΦΕΚ Υ.Ο.Δ.Δ. 114, 09/02/2024 και το ΦΕΚ Υ.Ο.Δ.Δ. 1430, 31/10/2025 το Διοικητικό Συμβούλιο του ΕΚΑΠΤΥ απαρτίζεται από τα ακόλουθα μέλη:
Δήμητρα Α.Μ. Παππά, Ιατρός Παθολογοανατόμος, Ιατρός Δημόσιας Υγείας, Διευθύνουσα Σύμβουλος & Πρόεδρος του ΔΣ
Βασιλική Φιλιππάτου του Γερασίμου, ΠΕ Νοσηλευτικής
Νικόλαος Δέδες του Παντελή, Γραμματέας Ένωσης Ασθενών Ελλάδος
Εμμανουήλ Μιγαδάκης του Χαράλαμπου, Ελεύθερος επαγγελματίας
Νικόλαος Κακαβάς του Κωνσταντίνου, Οδοντίατρος
Ιωάννης Κεχρής του Γεωργίου, Χειρούργος Εντατικολόγος

